当今社会人们对食品安全的越关注，就越加重视普通食品饮料质量和食材的卫生度。同时，另一个引起人们关注的是食品尽量避免使用添加剂和防腐剂。进行了某种处理而改变了其微生物正常补充的食品特别容易受环境微生物侵蚀。例如，酸牛奶、乳酪和其他奶制品，果汁、加味牛奶和主菜。蘑菇的生长有时也在食品净化车间里进行以防止条件性病原孢子生长过度。
    比如在一些大型设施要求100000级（ISO8和9级）以上。在美国，某乳酪公司在爱达荷州杰罗姆建造了一个3600万美元，面积140000平方英尺的乳酪和乳清产品厂。该厂有4个主要加热和通风系统可输送高达每分钟130000立方英尺的过滤效率为95％的空气，每小时换气15到20次。该食品净化车间采用正压，空气从加工区向外流。
    再比如，美国联邦农业部一项研究表明，美国的即食肉制品差不多有5％都感染了单核细胞增多性李氏菌（Listeriamonocytogenes），一种可以使人致命的食物传染病菌，可导致败血症、脑膜炎或脑膜脑炎（meningo-encephalitis），一种影响大脑和脊髓组织的疾病。对于孕妇来说，李氏菌属可引起胚胎夭折和死产。即食肉制品市场的扩大是增加对食品净化车间技术需求的一个因素。
    由此可见，食品净化车间已成为食品安全生产的的重要把关。